Образована на основании высочайше утвержденного 24 марта 1858 г. мнения Государственного Совета «Об увольнении охтинских поселян из Адмиралтейского ведомства, образовании из них пригородного общества с подчинением управы его С.-Петербургской городской думе». Комиссия учреждалась для приведения в действие положений закона и организации местного управления Охтинским пригородом. Состояла под председательством С.-Петербургского гражданского губернатора из чиновников от Министерства внутренних дел, управления С.-Петербургского военного генерал-губернатора, столичного городского головы и старшины ремесленного сословия. Находилась «под наблюдением» С.-Петербургского военного генерал-губернатора. К предметам ведения Комиссии относились: определение прав состояния и прав владения землей бывших охтинских поселян, устройство местного управления и хозяйства. Являлась надзорной инстанцией по отношению к должностным лицам и органам управления Охтинского пригородного общества (Охтинской пригородной управе и Собранию выборных Охтинского пригородного общества) в начальный период их деятельности.

Упразднена на основании именного указа от 18 мая 1862 г. «О закрытии Комиссии для устройства присоединенных к городу С.-Петербургу Охтинских поселений».

Документы о проведении размежевания земельных участков на Охте и наделении бывших охтинских поселян землей, о рассмотрении поземельных споров и жалоб бывших охтинских поселян (1848–1862 гг.).

Имеются циркуляры МВД о правилах проведения земельных съёмок, присланные в Комиссию для сведения за 1848–1858 гг.