Образована городской думой в апреле 1904 г. для разработки проекта реорганизации управления медицинскими учреждениями, подведомственными городскому самоуправлению. Фактически приступила к исполнению возложенных на нее обязанностей в 1910 году. Весной 1916 г. комиссия представила в Думу доклад «О реорганизации врачебно-санитарного дела в Петрограде», однако он не был рассмотрен городской думой.

Точная дата ликвидации комиссии не установлена. Последние сведения о ее деятельности относятся к 1916 году.

Журналы заседаний Комиссии, проекты докладов об учреждении и структуре Городской комиссии общественного здоровья, о реорганизации управления городскими больницами и богадельнями, устройстве новых больниц и городского аптечного склада и т.п. вопросам, связанным с преобразованием врачебно-санитарного дела в С.-Петербурге, статистические сведения по больничному и санитарному делу в столице (1910–1915 гг.).