Образован в 1776 г. в связи с введением в Новгородской губернии «Учреждений для управления губерний Всероссийской империи» от 7 ноября 1775 г. Состоял из двух бургомистров и четырех ратманов, избиравшихся городским купечеством и мещанством на три года. Являлся судом первой инстанции по уголовным и гражданским делам городских обывателей, регистрировал сделки по покупке домов и земли в пределах города. При магистрате состояли словесный и сиротский суды.

До 1781 г. апелляционной инстанцией для Новоладожского городового магистрата являлся Новгородский губернский магистрат . На основании именного указа от 11 декабря 1781 г. перешел в ведение С.-Петербургской губернского магистрата. «Грамотой на права и выгоды городам Российской Империи» от 21 апреля 1785 г. к компетенции магистрата дополнительно отнесены ведение книги с описанием всех городских домов, строений и земель, представления в губернское правление и губернский магистрат о замеченных недостатках и нуждах городского управления, а также надзор за цеховой организацией ремесленников, в т.ч. утверждение избрания глав ремесленных цехов.

На основании утвержденных 31 декабря 1796 г. новых губернских штатов губернские магистраты упразднялись . Именным указом от 4 сентября 1800 г. магистраты и ратуши уездных городов С.-Петербургской губернии передавались в ведение С.-Петербургского городового правления (ратгауза) . Именным указом от 12 февраля 1802 г. «О восстановлении разных присутственных мест и о штатном положении С.-Петербургской и Московской губерний» С.-Петербургский ратгауз упразднялся, магистраты и ратуши переходили под апелляцию палат уголовного и гражданского суда.

Ведомство магистрата в качестве суда первой инстанции распространялось на все уголовные и гражданские суда городских обывателей купеческого, мещанского и других податных сословий, а также тяжбы по торговым договорам и обязательствам. При магистрате функционировали сиротский и словесный торговый суды.

Прекратил свое существование на основании «Правила об упразднении магистратов и судебных ратуш», утвержденных 13 апреля 1866 г., в связи с ведением в С.-Петербургской губернии судебной реформы 1864 г. Административные функции магистрата перешли к органам городского общественного управления Новой Ладоги, судебные – в ведение мировых судей и окружного суда.

Дело по обвинению новоладожского купеческого сына Староверова И.Т. в избиении совместно с крестьянами селения Загубье смотрителя судоходства Свирского канала титулярного советника Ратькова.