Образовано в 1874 году для заведования строительством морского канала между Кронштадтом и С.-Петербургом и нового С.-Петербургского порта. Находилось в ведении Министерства путей сообщения. Состояло из комитета, в котором обсуждались все вопросы, касавшиеся устройства канала и порта, а также штата инженеров и техников, подчинявшихся инженеру-строителю. Последний непосредственно руководил строительством.

Основные работы были окончены к 1884 году. В 1887 году Управление упразднено, а заведование делами С.-Петербургского порта возлагалось на учрежденную при Министерстве путей сообщения «Временную комиссию по устройству коммерческих портов» и «Управление работами по устройству С.–Петербургского порта».

Доклады министра путей сообщения и директора Департамента шоссейных и водяных сообщений, переписка об учреждении комитета для рассмотрения проектов Морского канала и нового порта (1866–1874 гг.); отношение Морского министерства о необходимости постройки С.-Петербургского коммерческого порта (1877 г.); циркуляры и распоряжения Министерства путей сообщения (1876; 1886 гг.).

Документы деятельности Особого временного комитета и комиссии при комитете по выработке и утверждению проекта Морского канала (1872–1874 гг.); справка Департамента шоссейных и водяных сообщений с изложением проектов устройства порта и Морского канала, предложенных разным лицами (1872 г.). Документы об учреждении и положение о Временном управлении по устройству С.-Петербургского морского канала (1872–1874 гг.); журнал заседаний комитета временного управления (1874–1886 гг.); проекты и сметы на устройство канала, порта и портовой территории (1874–1887 гг.); доклад и переписка о стоимости устройства канала (1878–1880 гг.); документы об упразднении временного управления (1887 г.).

Отчеты о ходе работ (1875–1886 гг.); копия контракта с Обществом «Путилов, Кларк, Понгард и Ко» на постройку канала (1874–1875 гг.); переписка о переходе дел по постройке канала от Общества к временному управлению (1875–1876 гг.); договоры с подрядчиками, доклады, рапорты и переписка инженера-строителя о производстве нивелировки, топографической съемки, промеров и разбивки канала, буровых, землечерпательных и дноуглубительных работ, об устройстве дамб, набережных, бассейнов и железных дорог в портовой части канала, акты освидетельствования и приема работ, договоры и переписка о поставках землечерпательных машин, кранов, буксирных пароходов (1874–1887 гг.); инвентари имущества и машин (1876; 1878–1880 гг.); документы о происшествиях, последствиях наводнений и паводков (1879–1881 гг.); переписка об отчуждении земельных участков под строительство и отдаче их в аренду (1877–1911 гг.); планы земель (1884–1887 гг.); документы о приобретении части Гутуевского острова (1875–1877 гг.); проекты и сметы на сооружение Гутуевского коммерческого порта (1880–1881 гг.).

Правила временного движения судов по каналу (1882 г.); переписка о передаче канала в казну (1885–1887 гг.); о судоходстве по каналу (1884–1887 гг.); о разрешении разным лицам открытия пассажирского сообщения, складов и амбаров на канале (1885–1886 гг.); документы о контроле за ходом работ по строительству канала (1875; 1877–1878 гг.); об устройстве брандвахты и организации полицейского надзора за каналом (1884–1886 г.); переписка об открытии обелиска в память начала эксплуатации канала, проект обелиска (1885–1887 гг.).

Документы о выдаче жалования и наград служащим (1875–1876 гг.); переписка об утверждении штатов служащих временного управления (1874–1876 гг.).