В 1904 году открыты Стебутовские Санкт-Петербургские сельскохозяйственные курсы, в 1906 году – Санкт-Петербургские сельскохозяйственные курсы на Каменном острове, в 1908 году– Вечерние агрономические курсы Общества народного университета.

Согласно декрету Совета комиссаров Союза Коммун Северных областей от 22 октября 1918 г. курсы реорганизованы в государственные сельскохозяйственные институты: Стебутовский институт сельского хозяйства и лесоводства, Каменноостровский сельскохозяйственный институт и Петроградский агрономический институт. В 1920 году Петроградским Наркоматом просвещения принято решение об объединении Каменноостровского и Стебутовского институтов в Петроградскую сельскохозяйственную академию им. И.А. Стебута.

В 1922 году Петроградская сельскохозяйственная академии им. И.А. Стебута и Петроградский агрономический институт объединены в Петроградский сельскохозяйственный институт (с 1924 года – Ленинградский сельскохозяйственный институт).

В 1930 году Ленинградский сельскохозяйственный институт разделен на ряд институтов: Институт прядильных культур (ЛИПК), Молочно-огородный институт, Аграрно-педагогический институт (ЛАПИ), Институт механизации социалистического земледелия, а также созданы или выделены из других вузов: Ленинградский институт механизации сельского хозяйства, Ленинградский институт по борьбе с вредителями сельского хозяйства. В 1931 году из Молочно-огородного института выделены Ленинградский химико-технологический институт молочной промышленности и Плодово-овощной институт.

В 1934 году три института: Институт прядильных культур, Аграрно-педагогический институт и Ленинградский институт по борьбе с вредителями сельского хозяйства объединены в Ленинградский сельскохозяйственный институт. В 1934 году Молочно-огородный институт получил наименование Ленинградский институт социалистического молочного животноводства, в 1937 году – Пушкинский (Детскосельский) сельскохозяйственный институт. В 1941 году в состав Ленинградского сельскохозяйственного института включен в качестве факультета Плодово-овощной институт. В 1946 году зоотехнический факультет Ленинградского ветеринарного института переведен в Пушкинский сельскохозяйственный институт.

Приказом Министерства высшего образования СССР от 6 сентября 1948 г. №1296 Ленинградский сельскохозяйственный институт и Пушкинский сельскохозяйственный институт объединены и образован единый Ленинградский сельскохозяйственный институт (ЛСХИ). На основании приказа Министерства высшего образования СССР от 21 августа 1954 г. №799 в состав ЛСХИ вошел Ленинградский институт механизации сельского хозяйства на правах инженерного факультета.

За услуги в деле образования, обучения и воспитания специалистов для сельского хозяйства Указом Президиума Верховного Совета СССР от 26 января 1971 г. ЛСХИ награжден орденом Трудового Красного Знамени и стал называться – Ленинградский

ордена Трудового Красного Знамени сельскохозяйственный институт (ЛСХИ).

Приказом Государственной комиссии СМ СССР по продовольствию и закупкам от 11 января 1991 г. №5-к ЛСХИ преобразован в Ленинградский государственный аграрный университет.

Распоряжением Правительства РФ от 24 июля 1992 г. №1367-р и приказом Министерства сельского хозяйства РФ от 14 августа 1992 г. №402 Ленинградский государственный аграрный университет переименован в Санкт-Петербургский государственный аграрный университет.

Приказом Министерства сельского хозяйства и продовольствия РФ от 21 февраля 1997 г. №59 университет переименован в Государственное образовательное учреждение Санкт-Петербургский государственный аграрный университет.

Институт находился в ведении: Наркомата земледелия СССР (1939-1945), Министерства высшего образования СССР (1946-1955), Министерства сельского хозяйства СССР (1956-1985), Государственного агропромышленного комплекса СССР (1985-1989), Госкомитета СМ СССР по продовольствию и закупкам (1989-1992), Министерства сельского хозяйства РФ (1992-1994), Министерства сельского хозяйства и продовольствия РФ (1994-2000).

На 01.01.2016 – Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет» (ФГБОУ ВО «СПб ГАУ)».

Документы, касающиеся учебного процесса, планы и отчеты о деятельности института и т.п. находятся в ЦГА СПб (ф. Р-2996, ф. Р-5086, ф. Р-4352, ф. Р-6045) за 1918-1974 гг.

Научная документация (НД)

Диссертации и научно-исследовательские работы по тематике: растениеводство, животноводство, механизация сельскохозяйственных работ, сельскохозяйственная техника и энергетика, экономика сельского хозяйства.

Научно-исследовательские работы по тематике: изучение почв и разработка путей повышения их плодородия; изучение и освоение новых кормовых растений; создание устойчивой кормовой базы; изучение и разработка научных основ племенного дела, кормления и разведения сельскохозяйственных животных; исследование и разработка эффективных способов использования, технического обслуживания сельскохозяйственной техники; совершенствование организационной структуры и управления сельскохозяйственным производством; разработка методов статического и экономического анализа, планирования и др.

В числе документов: «Разработка и внедрение микропроцессорных средств автоматизации подкачивающих насосных станций мелиоративных систем», «Анализ данных по гидрохимическому режиму Невской Губы», «Разработка и изготовление макета спектро-электрофотометрической аппаратуры», «Эколого-фитоценотические основы создания и эксплуатации устойчивых продуктивных лугопастбищных травостоев и плантаций нетрадиционных кормовых культур».

Представлены работы специалистов в области: В.А. Брызгалова, Г.М. Добрынина,Н.А Дроздова, В.Н. Ефимова, Е.С. Каратаева, В.М. Крылова, И.В. Ларина, Р.Г. Насырова, В.Е. Советкиной, В.С. Шарашовой, Н.И. Щербинина, М.М. Юзбашева и других видных исследователей и преподавателей.