Политотдел СЗРП был создан в августе 1934 г. в соответствии с решением ХУП съезда ВКП(б), как организация чрезвычайного порядка на особо отстающем участке народного хозяйства. На состоявшейся 1 августа 1937 г. первой партконференции СЗРП указывалось, что задачей политотдела СЗРП являлось «установление руководства на правах парткомов всеми партийными и комсомольскими организациями, руководство партийно-массовой, политической и воспитательной работой, распределение кадров и работа с ними, увязка работы водницких парт-организаций с территориальными парторганизациями». В годы войны его главной задачей являлось обеспечение бесперебойной, четкой производственной работы транспортного конвейера. Политотдел СЗРП был ликвидирован в июне 1943 г. на основании решения ЦК ВКП(б) от 31 мая 1943 г. «О ликвидации политотделов на железнодорожном, морском и речном транспорте» и образован вновь в соответствии с постановлением СМ СССР № 4613 от 13 декабря 1948 г. в марте 1949 г. на основании приказа Министра речного флота СССР от 23 февраля 1949 г. Начальник политотдела являлся заместителем по политчасти начальника СЗРП. Политотдел СЗРП прекратил свою деятельность с ноября 1954 г. по постановлению Президиума ЦК КПСС от 30 октября 1954 г. «Об упразднении политических органов на речном транспорте». (Приказ по политотделу СЗРП от 26 ноября 1954 г. «О ликвидации политотдела в соответствии с приказом Министерства речного флота» от 13 ноября 1954 г.). С марта 1953 г. по август 1954 г. политотдел входил в систему Министерства морского и речного флота СССР.