В 1719 году образована община из немцев-лютеран, служивших на Литейном дворе. Первоначально они собирались для богослужений в одном из залов Берг-коллегии. В 1720 заложена деревянная церковь на 300 мест. Освящена как церковь Св. апостола Петра в 1722 году. В 1735–1740 гг. году по проекту архитектора П.М. Еропкина на средства императрицы Анны Иоанновны построена мазанковая церковь, освященная 26 октября 1740 г. в честь Святой Анны. Располагалась по Пятой линии Литейной части (позднее – Кирочная ул.). В 1775 году на ее месте заложен новый каменный храм по проекту архитектора Ю.М. Фельтена, освященный 24 октября 1779 г.

В 1850, 1867–1868, 1894, 1900 гг. производился ремонт и частичная перестройка церковного здания. Адрес – Кирочная ул., 8.

При церкви действовали: немецкая школа «Анненшуле» (с 1736 г.), школа для девочек (с 1780 г.), сиротский дом (с 1784 г.), Мариинский приют (с 1844 г.), сиротская школа (с 1850 г.), богадельня для бедных девиц мещанского звания «Фридрих-Юльевская» (1895 г.), богадельня Фридриха Гартоха для неизлечимо больных лиц обоего пола.

На основании постановления Наркомюста от 18 августа 1918 г. «О порядке проведения в жизнь декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» независимо от конфессии» церковь лишалась прав юридического лица, а ее имущество подлежало национализации. Закрыта в 1935 году.

Указы С.-Петербургской евангелическо-лютеранской консистории (1850–1851гг.); уложения о порядке выборов пасторов и членов церковного совета [1913 г.]; протоколы заседаний церковного совета (1909–1925 гг.).

Метрический книги о родившихся (1740–1749 гг.).

Протоколы заседаний Общества призрения бедных при церкви (1859–1919 гг.); прошения частных лиц об оказании помощи (1903–1910 гг.); книга записей платы за обучение воспитанников Мариинского приюта (1844–1918 гг.).

Имеются документы Лейпцигской евангелическо-лютеранской миссии, в т.ч.: годовые отчеты за 1864–1867 гг., переписка с пасторами различных городов о продаже библии, квитанции миссии в получении денег из России (1865–1867 гг.).