Образован в 1780 году на основании высочайше утвержденного 7 ноября 1775 г. акта «Учреждения для управления губерний Всероссийской империи» для рассмотрения гражданских и уголовных дел лиц всех сословий, не имеющих недвижимой собственности в столице и губернии, включая лиц, состоящих на гражданской или придворной службе, а также военных по обязательствам гражданского характера. Являлся апелляционной инстанцией на решения нижнего надворного суда. Делился на два департамента: 1-й – для решения уголовных дел и 2-й – для решения гражданских дел.

В 1796 году ликвидирован, поскольку в столице был оставлен только один надворный суд.

Указы и распоряжения С.-Петербургского губернского правления, палаты гражданского суда и др. учреждений (1788–1795 гг.); указы С.-Петербургского губернского правления о наложении запрещений на продажу заложенных имений, купчие, закладные и векселя (1791; 1795 гг.).

Журналы и протоколы заседаний, определения верхнего надворного суда (1785–1797 г.); рапорты и ведомости С.-Петербургского нижнего надворного суда о решенных и нерешенных делах (1792–1793 гг.).

Судебные дела по донесениям и распоряжениям губернского правления, верхнего земского и нижнего надворного судов, управы благочиния о привлечении к ответственности за совершение различных уголовных преступлений и правонарушений, нарушение общественного порядка и «благочиния»; о наказании крепостных и дворовых за побеги от помещиков и возвращении их владельцам (1780–1796 гг.); апелляционные дела на решения нижнего надворного суда по имущественным искам и тяжбам, о взыскании денег по векселям и долговым обязательствам, утверждении духовных завещаний и т.д. (1780–1801 гг.).

Книга записи решений и апелляционных жалоб на решения нижнего надворного суда (1795 г.).

Донесения С.-Петербургского нижнего надворного суда о продаже и покупке имений (1782–1783гг.); сообщения Дворянского заемного банка и донесения С.-Петербургского опекунского совета Воспитательного дома о заложенных имениях и крепостных людях, доверенности и справки Заемного банка о продаже и закладе имений (1783–1796 гг.).

Книги записи купчих и закладных на землю, крепостных, дворы, лавки и другое имущество, отпускных на «волю», доверительных писем и духовных завещаний (1780–1797 гг.); прошения крепостных крестьян и дворовых о записи отпускных на волю (1781–1796 гг.); купчие крепости (1782–1795 гг.).

Расходная книга суда (1798 г.).

Докладные и настольные реестры за 1785 и 1792–1793 гг.; реестры и журналы регистрации входящих и исходящих документов за 1794–1795 гг.