В 1892 году на Гутуевском острове по проекту гражданского инженера В.А. Косякова и инженера Б.К. Правдина заложена церковь в русском стиле XVII века на 1400 прихожан. Первоначально воздвигалась в память «чудесного» спасения царской семьи при крушении поезда в Борках 17 октября 1888 г. и внешним видом повторяла мемориальных храм Христа Спасителя в с. Борки Харьковской губернии. Позднее была посвящена спасению наследника цесаревича Николая Александровича (будущего императора Николая II) от нападения японца-фанатика в городе Отсу 29 апреля 1891 г. Строилась на средства, пожертвованные купцом И.А. Ворониным, а также др. купцами и чиновниками, работавшими в торговом порту на Гутуевском острове. Постройка каменного с колокольней храма продолжалось в течение 1892–1899 гг. В апреле 1899 г. освящен главный придел во имя Богоявления Господня. В июле того же года освящен придел во имя Иоанна Постника.

День 29 апреля ежегодно отмечался в церкви торжественным богослужением, с 1912 года – крестным ходом. При храме была устроена семейная усыпальница купцов Ворониных, действовало приходское попечительство и бесплатная библиотека.

Декретом СНК от 23 января 1918 года «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» церковь лишалась прав юридического лица, ее имущество подлежало национализации. Закрыта в 1935 году.

Указы Святейшего Синода (1917 г.), Петроградской духовной консистории (1899–1910; 1917–1918 гг.) и Петроградского епархиального совета (1918–1920 гг.).

Протоколы заседаний президиума «двадцатки» (1927–1928 гг.) ; протоколы общих собраний прихожан (1919–1920; 1922 гг.).

Инструкция настоятелям столичных церквей (б/д);рапорты причта благочинному (1899–1910 гг.); акты обозрения церкви (1915; 1918 гг.);

Метрическая книга о родившихся (1918 г.); клировые ведомости церкви (1901–1916 гг.); приходская книга с указанием сведений о прихожанах, причте и членах их семей; (1918–1925 гг.).

Переписка причта церкви с благочинным и директором Департамента таможенных сборов о назначении на должности, награждении, выделении средств на содержание причта (1899–1917 гг.); об открытии земской начальной школы в д. Волынкино (1902 г.); переписка причта церкви с С.-Петербургской городской думой, управой и Финансовой комиссией при Городской думе и др. об отчуждении участка городской земли под постройку церковного дома (1902–1909 гг.).

Приходо-расходные книги (1927–1931 гг.); подписные листы по сбору пожертвований (1917; 1927 гг.) и членских взносов (1917 г.); договоры о передаче в пользование верующих здания церкви (1927; 1930 гг.).