Согласно постановлению СНК СССР от 17 декабря 1932 г. образовано Гидрографическое управление Главного управления Северного морского пути (Главсевморпути) при СНК СССР. Его целью было проведение гидрографических изысканий и исследований трассы Северного морского пути, оборудование ее (трассы) средствами навигационного ограждения, осуществление лоцманской проводки судов. В 1953 года управление перешло в подчинение Министерства морского флота (ММФ) СССР. 31 марта 1954 года реорганизовано в Гидрографическое предприятие Главсевморпути ММФ СССР. С 28 апреля 1964 года подчинено непосредственно ММФ СССР.

Структура на 1969 год:

- Секретариат;

- Отделы: флота, планово-производственный, навигационного ограждения и радионавигации, кадров;

- Группа техники безопасности;

- Гидрагорафическая экспедиция №11;

- Бухгалтерия.

В соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 20.08.1991 №66 Гидрографическое предприятие было передано в ведение Министерства транспорта Российской Федерации и получило название "Государственное гидрографическое предприятие".

На основании Решения Регистрационной палаты Администрации Санкт-Петербурга от 11.08.1999 №158351 Государственное гидрографическое предприятие переименовано в Государственное унитарное гидрографическое предприятие Министерства транспорта Российской Федерации.

Структура на 1990-2000 годы:

- Административно-управленческий аппарат;

- Отделы: первый, бухгалтерского учёта, отчётности и ревизии, планово-производственный, материально-технического сеабжения, навигационно-гидрографического обеспечения общего мореплавания, маркетинга, руководств, пособий и навигационных карт Северного морского пути;

- Арктическая служба навигационного оборудования и радиационной безапасности;

- Комплексная арктическая гидрографическая экспедиция (КАГЭ);

- Объединённый арктический радионавигационный отряд (ОАРНО).

С 2004 года - Федеральное Государственное унитарное гидрографическое предприятие Министерства транспорта Российской Федерации.

В состав входили следующие филиалы: Архангельская, Диксонская, Игарская, Хатангская, Тиксинская, Колымская, Провиденская арктические гидрографические базы и Певекский лоцмейстерско-гидрографический отряд, действующие на основании Положений и доверенностей их руководителям. Все филиалы выделены на отдельные балансы, бухгалтерский учёт велся на местах своими учётными подразделениями.

Основные направления работы предприятия - изучение подводного рельефа Арктических морей и внутренних водных путей в целях издания навигационных карт, составления руководств и пособий для плавания, оборудование трасс средствами навигационного ограждения и обеспечение их работы, информирование мореплавателей об изменениях навигационной обстановки, осуществление лоцманских проводок на реках Енисей, Хатанга, Анабар и Колыма, выполнение мероприятий по предотвращению загрязнения арктических морей нефтепродуктами.

Положения (1935, 1957 гг.); приказы (1951-1969 гг.). Протоколы производственных совещаний, в том числе о составлении планов, по вопросам деревянного судостроения (1933 г.). Протоколы совещаний редакционной коллегии издательства журнала «Записки по картографии» (1933 г.), расширенного заседания Бюро полярной комиссии (1934 г.), картографической комиссии по проверке и корректировке карт (1935-1936 гг.). Постановление междуведомственного совещания о работе управления в области освоения Северного морского пути в 1933 г. (ф. Р-7171). Планы, отчеты управления (предприятия): производственные, капитальных вложений, организационно-технических мероприятий, финансовые.

Планы, отчеты Красноярского, Омского, Сибирского, гидрографических управлений, Архангельской, Диксоновской, Провиденской, Тиксинской гидрографических баз, Колымского, Новоземельского, Чукотского отрядов и др. Аварийные акты гидрографических судов (1942-1950 гг.).

Личные дела, списки сотрудников за 1930-1938 гг. (ф. Р-7171).

Документы отделов: канцелярии, планово-производственного, охраны труда, бухгалтерии, флота за 1990-1992 гг.; приказы начальника по основной деятельности, штатные расписания за 1990-2004 гг.

Приказы по личному составу, лицевые счета и карточки по зарплате рабочих и служащих, трудовые договора за 1933-1945 гг.

Личные дела рабочих и служащих за 1936-1945 гг.