Учреждено в марте 1901 г. в связи с распространением в С.-Петербурге эпидемии оспы. Координировало мероприятия по борьбе с инфекционными заболеваниями, вело медицинскую статистику, давало свои заключения по возникающим в Городской думе вопросам санитарно-эпидемиологического характера. Возглавлялось Бюро старшим санитарным врачом и находилось в ведении Городской исполнительной санитарной комиссии. Ликвидировано в ноябре 1917 г. в связи с роспуском Городской думы.

Циркуляры, постановления и их проекты С.-Петербургской городской думы по санитарной части, распоряжения правительственных и местных учреждений (1901–1913 гг.). Журналы заседаний санитарных врачей и попечительств (1902–1915 гг.); отчеты санитарных и думских врачей, изоляционных убежищ, дезинфекционных камер и холерных пунктов, ведомости городских больниц о движении больных (1902–1916 гг.). Доклады и сообщения санитарных врачей, отчеты, ведомости, статистические сведения и переписка с Санитарной и Больничной исполнительными комиссиями, Столичным врачебным управлением, санитарными попечительствами и больницами о распространении инфекционных заболеваний в городе и о мерах по борьбе с ними (1901–1916 гг.); протоколы санитарных осмотров, документы бактериологических исследований и заключения санитарных врачей о санитарном состоянии жилых помещений, торговых и промышленных заведений, мест проведения строительных работ, рек, каналов, кладбищ, продуктов питания и т. д. (1902–1916 гг.). Финансовые отчеты и сметы Санитарно-эпидемиологического бюро (1907–1911; 1914 гг.).

Списки персонала изоляционных квартир, дезинфекционных камер и др. учреждений, подведомственных Исполнительной санитарной комиссии, прошения об определении на службу, ведомости на выдачу вознаграждения и другие документы по личному составу служащих Бюро, врачей, фельдшеров, дезинфекторов и санитаров (1901–1915 гг.); расписание дежурств санитарных врачей (1911; 1916–1917 гг.).