В 1903 году православным эстонским братством устроена временная церковь. Помещалась в зале для бесед и примыкающих к нему классах в доме Братства. Постоянная церковь заложена в этом же году; окончательно построена и освящена в 1907 году. Каменная, пятиглавая, двухярусная, с колокольней; четырёхпрестольная по адресу Екатерингофский пр., 24 и Лермонтовский пр., 11. Декретом СНК от 23 января 1918 года «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» церковь была лишена прав юридического лица, а имущество ее подлежало национализации. В документах фонда последние сведения о деятельности церкви относятся к 1932 году. Закрыта в феврале 1935 года.

Протоколы заседаний приходского совета (1917-1913 гг.); протоколы общих собраний прихожан (1906-1908; 1917-1923 гг.); клировые ведомости (1902-1917 гг.); метрическая книга (1919 г.); финансовые отчёты; сметы (1925-1930 гг.); приходо-расходные книги (1916-1924 гг.); опись имущества церкви (1923 г.); документы об устройстве парового отопления и вентиляции в здании церкви: проекты и пояснительные записки к ним, сметы (1903 г.); списки членов приходского совета и его уполномоченных, ревизионной комиссии, служителей церкви (1924-1932 гг.); документы о деятельности православного эстонского братства Во имя священномученика Исидора Юрьевского: протоколы заседаний организационного комитета и Совета братства; списки членов Совета братства (1898-1913 гг.); устав Исидоровской эстонской приходской общины (б/д); документы об образовании религиозного общества «Православная русско-эстонская Исидоровская церковь»: протокол собрания учредителей; заявление и удостоверение о регистрации; список учредителей (1930 г.).