В 1906 году было открыто учебное заведение первого разряда. Преобразовано в 1907 году в женскую гимназию Ю. С. Ивановой с правами для учащихся женских гимназий Министерства народного просвещения. В 1911 году реорганизована в Преображенскую «Новую школу» Товарищества учителей. Находилась в ведении попечителя С.-Петербургского (Петроградского) учебного округа. Передана в ведение Народного комиссариата просвещения на основании декрета СНК от 5 июня 1918 г.

Циркуляры попечителя С.-Петербургского (Петроградского) учебного округа (1881–1917 гг.); распоряжения Народного комиссариата просвещения (1917–1925 гг.). Переписка с попечителем С.-Петербургского (Петроградского) учебного округа, другими учреждениями и частными лицами об открытии, организации учебного процесса, открытии классов и курсов при гимназиях, стоимости обучения (1857; 1873–1918 гг.). Годовые отчёты, отчёты по учебной части, статистические сведения о гимназиях (1884–1917 гг.); протоколы заседаний попечительских, педагогических советов и собраний преподавателей (1881–1919 гг.); документы о деятельности родительских комитетов, в т. ч. протоколы заседаний комитетов, списки родителей учениц (1907–1918 гг.). Правила приёма, программы обучения, учебные планы (1891–1893; 1898–1916 гг.); расписания и конспекты уроков (1883–1888; 1900; 1911–1917 гг.); классные журналы, отчёты классных наставников, журналы успеваемости и поведения учениц, экзаменационные ведомости и работы учениц (1873–1925 гг.). Переписка о проведении экскурсий, литературных чтений, концертов, благотворительных вечеров, праздновании юбилеев гимназий (1906–1918 гг.); о медицинском обслуживании учениц, отчёты о санитарном состоянии гимназий (1898–1899; 1906; 1912–1915 гг.); отчёты гимназических библиотек, списки учебной литературы и инвентаря (1883–1917 гг.). Документы об организации и деятельности обществ вспомоществования нуждающимся ученицам гимназий и школьных сиротских фондов, в т. ч. уставы и протоколы заседаний обществ (1894; 1907–1918 гг.); постановление педагогического совета 8-й советской трудовой школы (бывш. 3-й гимназии) о праздновании 100-летнего юбилея за 1922 г. (ф. 148). Сметы расходов, главные и кассовые книги, приходо-расходные документы гимназий (1881–1882; 1892–1918 гг.). Прошения о приёме на службу, формулярные списки, личные дела, карточки-формуляры, списки преподавателей и служащих, наградные списки, разрешения на право преподавания, свидетельства об окончании учебных заведений, адресные книги, книги и ведомости на выдачу жалования (1881–1928 гг.); личные документы М. Н. Стоюниной (1888 г.); рукописи выступлений, воспоминания М. Н. Стоюниной об организации гимназии (упоминаются А. П. Бородин, С. П. Боткин, А. Г. и Ф. М. Достоевские, П. Ф. Лесгафт, А. А. Оболенская, А. Л., Н. А. и В. А. Пушкины, К. А. Раухфус, А. Л. Толстой, В. Г. Чертков, Н. Я. Ярошенко; б/д). Прошения о приёме и об освобождении от платы за обучение, приёмные книги, списки учениц, стипендиатов и выпускниц гимназий, личные дела, характеристики, метрические свидетельства, свидетельства и аттестаты об окончании учебных заведений, адресные книги, фотографии учениц (1878–1925 гг.).