На основании распоряжения мэрии Санкт-Петербурга от 01.07.1992 № 614-р на базе санитарно-пищевой лаборатории создан Центр контроля качества продовольственных и косметических товаров мэрии Санкт-Петербурга.

Структура центра в 1994 году была следующей:

- Директор

- Заместитель

- Главный бухгалтер

- Главный экономист

- Бухгалтер

Отдел экспертизы продовольственных товаров

- Отдел экспертизы косметических товаров

-Отдел испытаний продовольственных и косметических товаров

Сектор испытаний продовольственных товаров

Сектор испытаний косметических товаров

Сектор исследования токсичных элементов

Сектор по бактериологическим исследованиям

На основании распоряжения Комитета по управлению городским имуществом от 27.06.1997 № 609-р центр контроля качества продовольственных и косметических товаров мэрии Санкт-Петербурга переименован в Санкт-Петербургское государственное учреждение «Центр контроля качества продовольственных и косметических товаров».

На основании распоряжения Комитета по управлению городским имуществом от 04.02.2002 № 189-р Санкт-Петербургское государственное учреждение «Центр контроля качества продовольственных и косметических товаров» переименовано в Санкт-Петербургское государственное учреждение «Центр контроля качества товаров (продукции), работ и услуг».

Структура Центра время от времени изменялась, в 2008 году она была следующей:

- Аппарат управления Центром

- Администрация

- Сектор кадров, ГО и ЧС, воинского учета

- Бухгалтерия

- Группа по работе с государственным заказом

- Отдел контроля качества продукции и услуг по обращениям потребителей

- Хозяйственный отдел

- Вспомогательная служба Центра

Группа документационного обеспечения

Сектор по транспорту

Сектор по перспективным разработкам

Сектор по связям с общественностью

Группа компьютерно-технического обеспечения

- Испытательная лаборатория «Петербург-Экспертиза»

Администрация

Сектор физико-химических испытаний

Группа испытаний парфюмерно-косметической продукции, средств, бытовой химии и моющих средств сектора физико-химических испытаний

Сектор определения токсичных веществ

Группа определения веществ и консервантов

Группа определения солей тяжелых металлов

Сектор бактериологических исследований

Вспомогательная служба Испытательной лаборатории «Петербург-Экспертиза»

Хозяйственный сектор Испытательной лаборатории «Петербург-Экспертиза»

- Центральный орган Системы добровольной сертификации «Петербургская марка качества»

- Орган по сертификации продукции и услуг АЯ 61

Отдел сертификации серийно-выпускаемой продукции

Отдел сертификации услуг розничной торговли

Отдел сертификации продукции

Отдел сертификации услуг общественного питания и парикмахерских

Отдел по сертификации парфюмерно-косметической продукции

Вспомогательная служба органа сертификации

Информационно-техническая группа

- Отдел аналитической работы и межведомственной координации

Сектор аналитической работы

Сектор межведомственной координации/Отдел экспертизы качества и оценки признаков контрафактности продукции

- Отдел взаимодействия с органами исполнительной власти по защите прав потребителей

- Отдел по декларированию розничной продажи алкогольной продукции

Сектор по техническому вводу информации

Сектор приема, учета и регистраций деклараций

Архивная группа

- Отдел реестра объектов и территорий

- Отдел обеспечения деятельности розничного рынка

Сектор по изучению спроса

Сектор организации торговой деятельности

Приказы директора по основной деятельности (1994–2008 гг.). Сводная смета доходов и расходов на 2003, 2004, 2006 гг. Распоряжения директора по основной деятельности 2008 г.